我们可能认为自己知道自己的身体是如何工作的,但研究人员不断寻找新的方式让我们感到惊讶。最近该杂志报道了一项最新发现自然化学生物学 —与mRNA去盖复合体相互作用的人类微蛋白是这篇论文的名字,它描述了耶鲁大学和索尔克研究所的研究人员如何设计一种新的检测策略来发现微蛋白。


微蛋白-隐藏在显而易见的地方

微蛋白是比普通蛋白质短的蛋白质,通常只有一个结构域。除此之外,人们对它们知之甚少。这是因为它们的大小和难以找到。这项研究的研究人员已经确定了一种“新的”功能性微蛋白,它是人类基因组的一部分。


生物学家面临的问题是,这些微小的蛋白质通常被细胞中的所有其他物质所隐藏。传统的检测方法在寻找这些微蛋白方面没有用处。如果看不到它们,生物学家就无法确定它们的功能是什么,以及它们在细胞生命中是否发挥了任何有用的作用。


正如论文作者之一、索尔克研究所的阿兰·萨加泰利安所说:


“尽管我们对人类基因组了解多少,但基因组发现算法仍然存在盲点。你可以对整个人类基因组进行测序,却永远不会知道有一种蛋白质,像这样的蛋白质,因为它太短,低于基因分配算法的通常长度要求。”


没人在家

耶鲁大学的研究人员发现了一种叫做NoBody的微蛋白-或未注释的P体解离多肽。在身体的每一个细胞中,DNA被转录成信使RNA(mRNA),信使RNA用于制造蛋白质。但是,在蛋白质生成后,必须阻止RNA再生成蛋白质。所有这一切都是众所周知的——这是在高中教的——但我们不知道微蛋白NoBody的作用。


为了找到细胞中的微蛋白,研究人员将基因组测序和蛋白质组学结合起来,找到了未注释的微蛋白。分离细胞内容物并去除较大的蛋白质。然后,他们使用液相色谱-质谱蛋白质组学分析样品中蛋白质和微蛋白的氨基酸序列。本文讨论了色谱法在生物样品中的应用,高效液相色谱(HPLC)柱在生物分子分析中的应用 .


研究人员随后开发了一种计算方法,以便建立样本中所有可能存在的蛋白质的数据库,他们还发现了400多个新的微蛋白。该团队认为,微蛋白在细胞生物学中发挥着重要作用,包括在疾病中。也许有一天NoBody可以帮助我们治愈疾病。